Aynı isimli video oyunu serisinden uyarlanan NiNoKuni, hayatı tehlikede olan çocukluk arkadaşları Kotona'yı kurtarmak için iki ayrı ama paralel dünya arasında seyahat etmek zorunda kalan lise akranları Yuu ve Haru'yu konu alıyor. Aşkla karmaşık hale gelen bu büyülü arayışta üç genç, nihai seçimi yapmakla görevlendirilecek.