Dev bir mekanize dövüş kıyafeti olan Aquarion, insanlığın yıldızlararası tehditlere karşı en iyi silahıdır. İnsan pilotlar binlerce yıl boyunca Gölge Melekleri, istilacı Kaçırıcıları ve kinetik enerji canavarlarını yenmek için eğitim aldı ve birlikte çalıştı. İnsanlık bir kez daha Aquarion'a dönmeli. Dünyanın kaderi tehlikedeyken, kostüm insanlığı kurtarmaya yetecek mi?